Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms