Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc5P62196 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms