Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2fP61219 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms