Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arf3P61205 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arf3P61205 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arf3P61205 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms