Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf1P61148 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fgf1P61148 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms