Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ActbP60710 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ActbP60710 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ActbP60710 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ActbP60710 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ActbP60710 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ActbP60710 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ActbP60710 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ActbP60710 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ActbP60710 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms