Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps33bP59016 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33bP59016 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33bP59016 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms