Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P58686 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P58686 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P58686 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P58686 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P58686 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P58686 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P58686 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P58686 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P58686 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P58686 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P58686 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P58686 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P58686 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P58686 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P58686 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P58686 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P58686 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms