Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf16P58334 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms