Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp25P57080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms