Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmchP56942 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmchP56942 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PmchP56942 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmchP56942 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmchP56942 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmchP56942 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmchP56942 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms