Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms