Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CckbrP56481 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms