Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp5P56399 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp5P56399 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms