Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6b1P56391 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox6b1P56391 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox6b1P56391 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms