Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defb1P56386 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defb1P56386 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms