Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a1P55014 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms