Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RabggtbP53612 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtbP53612 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RabggtbP53612 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RabggtbP53612 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RabggtbP53612 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
RabggtbP53612 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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