Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Map3k1P53349 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Map3k1P53349 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms