Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e1P52482 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms