Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbp3P49194 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms