Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms