Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Neurod6P48986 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod6P48986 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod6P48986 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms