Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms