Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VdrP48281 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VdrP48281 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VdrP48281 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VdrP48281 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VdrP48281 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VdrP48281 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VdrP48281 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VdrP48281 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VdrP48281 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms