Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic1P46684 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic1P46684 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic1P46684 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms