Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms