Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f2P43135 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms