Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf5P43027 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf5P43027 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms