Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HttP42859 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HttP42859 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HttP42859 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HttP42859 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HttP42859 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HttP42859 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HttP42859 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HttP42859 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HttP42859 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HttP42859 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HttP42859 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HttP42859 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HttP42859 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HttP42859 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HttP42859 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HttP42859 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HttP42859 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HttP42859 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HttP42859 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HttP42859 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HttP42859 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HttP42859 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HttP42859 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HttP42859 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HttP42859 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms