Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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