Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VhlP40338 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VhlP40338 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VhlP40338 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VhlP40338 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VhlP40338 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VhlP40338 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VhlP40338 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VhlP40338 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VhlP40338 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VhlP40338 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VhlP40338 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VhlP40338 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VhlP40338 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VhlP40338 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VhlP40338 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms