Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf1P39428 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf1P39428 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf1P39428 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf1P39428 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf1P39428 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf1P39428 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf1P39428 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf1P39428 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf1P39428 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms