Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pola1P33609 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pola1P33609 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pola1P33609 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pola1P33609 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms