Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc5P32043 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms