Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcam1P29533 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms