Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb1P28230 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms