Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2afxP27661 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms