Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarsP26638 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarsP26638 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarsP26638 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarsP26638 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarsP26638 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarsP26638 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarsP26638 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarsP26638 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarsP26638 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SarsP26638 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarsP26638 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarsP26638 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarsP26638 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarsP26638 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarsP26638 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarsP26638 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarsP26638 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarsP26638 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarsP26638 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarsP26638 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarsP26638 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarsP26638 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarsP26638 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms