Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb7P26011 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms