Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou2f1P25425 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms