Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd247P24161 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cd247P24161 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd247P24161 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd247P24161 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd247P24161 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd247P24161 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms