Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZfaP23607 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZfaP23607 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZfaP23607 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZfaP23607 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZfaP23607 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZfaP23607 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms