Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clk1P22518 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clk1P22518 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clk1P22518 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms