Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F3P20352 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F3P20352 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F3P20352 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
F3P20352 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F3P20352 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F3P20352 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F3P20352 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F3P20352 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F3P20352 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F3P20352 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
F3P20352 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F3P20352 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F3P20352 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F3P20352 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F3P20352 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms