Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VimP20152 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VimP20152 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VimP20152 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VimP20152 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VimP20152 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VimP20152 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VimP20152 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VimP20152 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VimP20152 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VimP20152 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VimP20152 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms