Protein–RNA interactions for Protein: P18155

Mthfd2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd2P18155 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mthfd2P18155 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mthfd2P18155 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mthfd2P18155 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms