Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou4f1P17208 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou4f1P17208 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms