Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ass1P16460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms