Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms